二氧化氯杀菌消毒效果较强,国外称它为信得过的化学消毒剂,是氯制剂的较好替代品。我国原卫生部已批准二氧化氯为消毒剂,GB/T 20783-2006 稳定性二氧化氯溶液国家标准强制实施;用于食品环境消毒及消毒;《生活饮用水卫生标准》GB 5749-2006增加二氧化氯为饮用水消毒剂,于2007年7月1日起强制实施。
二氧化氯的杀菌、消毒、除异味效果佳,因此在饮用水处理、水产禽畜养殖、果蔬种植、医疗卫生、公共环境、工业循环水污水处理等行业得到了广泛的应用。